Losovací procedury se ujali ambasador MOL Cupu Jan Koller a Tomáš Hübschman. I zápasy 2. kola proběhnou v rámci oddělené české resp. moravské části, kde byly kluby navíc rozděleny na licenční (první a druhá liga) a nelicenční (třetí liga a níž).
Pořadatelem zápasu je klub z nižší soutěže, případně prvně vylosovaný tým. Opět platí, že kluby z druhé ligy na sebe nemohou narazit.
Do 2. kola už zasáhne i většina prvoligových celků s výjimkou klubů, které hrají evropské soutěže UEFA, včetně jejich kvalifikačních částí. Konkrétně se jedná o týmy SK Slavia Praha, FC Viktoria Plzeň, FC Baník Ostrava, AC Sparta Praha a SK Sigma Olomouc, které doplní ještě FC Hradec Králové jakožto vítěz play-off první ligy o 7. až 10. místo.
V Brandýse nad Labem se mohou těšit na souboj s prvoligovým Libercem. Pražští Bohemians zavítají na hřiště Hostouně a Pardubice se vydají na hřiště třetiligové České Lípy.
Na prvoligového soupeře se mohou těšit také Rokycany, které v prvním kole vyřadily Příbram. V druhém kole vyzvou Mladou Boleslav.
Také v Bohumíně a Hodoníně se mohou těšit na prvoligového soupeře, když se utkají s Karvinou a Slováckem.
V utkáních druhého kola, stejně v jako v 1. kole, budou za nerozhodného stavu o postupujícím rozhodovat pokutové kopy.
Hracím dnem druhého kola je středa 27. srpna 2025, přesné termíny jednotlivých zápasů budou zveřejněny později.
| MOL Cup 2025/2026 - los 2. kola |
| Termíny MOL Cupu 2025/2026: |
http://www.fotbal.cz/facr/mol-cup-2025-2026-los-druheho-kola/a22746