Infekční oddělení českobudějovické nemocnice dlouhodobě spolupracuje s Laboratoří arbovirologie v Biologickém centru Akademie věd ČR na výzkumu nemocí přenášených klíšťaty. Výsledky výzkumů byly již několikrát publikovány v prestižních odborných časopisech.
Mezi další významné publikační úspěchy lékařů Infekčního oddělení se pak řadí souhrnná přehledová práce mezinárodního kolektivu autorů, která dosáhla již více než 340 citací v odborné literatuře. Další článek vydaný v renomovaném časopise zaměřeném na virologii byl vydavatelstvím Wileyoznačen jako jeden z nejčtenějších článků v roce 2024.Během jednoho roku od svého vydání byl citován již více než třicetkrát.