Cenu nadace Dimitrise N. Chorafase získal za Univerzitu Karlovu Michael Jacob Bakker z Farmaceutické fakulty UK, a sice za výzkum, jenž propojuje chemii, biologii a moderní výpočetní metody ve snaze lépe porozumět onemocněním, a tudíž je i lépe léčit.
Cena Dimitrise N. Chorafase je každoročně udělována nadací téhož jména a ve spolupráci s izraelským Weizmannovým institutem nadějným vědkyním a vědcům. Farmaceut Michael Jacob Bakker ji letos získal za práci Studium vnitřně neuspořádaných proteinů a jejich post-translačních modifikací pomocí metod molekulové dynamiky a klastrovacích technik.
Výzkum dr. Bakkera se zaměřuje na intrinsicky neuspořádané proteiny a jaderné receptory, molekuly, které hrají klíčovou roli u onemocnění, jako je Alzheimerova choroba nebo rakovina. Tyto proteiny jsou mimořádně flexibilní a obtížně studovatelné, avšak díky jeho odborným znalostem v oblasti molekulárních simulací, bioinformatiky a strojového učení pomohl odhalit, jak jejich pohyby a chemické modifikace ovlivňují patologické procesy.
Během svého doktorského studia na Univerzitě Karlově zkoumal dynamické chování proteinů, jako jsou p53, Tau a MAP2c, a přinesl nové poznatky o tom, jak Tau vytváří škodlivé plaky v mozku a jak flexibilita p53 ovlivňuje jeho funkci jako nádorového supresoru. Jeho pobyt na Lund University dodal jeho práci experimentální rozměr: kombinoval počítačové modely se skutečnými biofyzikálními měřeními – vzácná a mimořádně silná kombinace v moderní vědě.
Nyní, jako postdoktorandský výzkumník a pedagog na FaF UK dr. Bakker dále posouvá hranice výpočetní biologie. Usiluje o hlubší pochopení nukleárních receptorů a pracuje na návrhu nových metod cílené protinádorové terapie.
Text: Jitka Jiřičková
Foto: Vladimír Šigut