V dubnu a květnu 2024 jsme mapovali využití umělé inteligence na 2. lékařské fakultě. Rozeslali jsme dotazník, v němž jsme se ptali, jaký druh AI výzkumníci využívají, v jakých oblastech činnosti, v jakých významných projektech a s kým spolupracují. Ze všech oslovených zaměstnanců (cca 750) se ozvalo 25 výzkumníků, vesměs vedoucích pracovišť nebo skupin.
Pracoviště. Ve využití AI existuje skupina pracovišť, pro jejichž portfolio odborných činností nebo významné běžící projekty je AI velmi významná (především Ústav bioinformatiky, Neurologická klinika, Klinika dětské hematologie a onkologie, Klinika zobrazovacích metod, Ústav biologie a lékařské genetiky). Některá pracoviště AI využívají v jednotlivých projektech (Stomatologická klinika). Další využívají AI pro činnosti přímo nesouvisející s výzkumem.
Spolupráce. Pracoviště spolupracují s jinými institucemi, nejčastěji s ČVUT, dále s AV ČR, ale i se zahraničními univerzitami (Tampere, Kodaň) a tuzemskými technologickými firmami (IBM, Neurona, BohemAI).
Vybíráme z odpovědí:
Doc. Karel Fišer, přednosta Ústavu bioinformatiky: Na AI jsou založené všechny naše projekty. Hlavní oblastí našeho zájmu jsou sekvenační data a data z měření velkého množství jednotlivých buněk.
Prof. Jakub Hort, vedoucí Kognitivního centra, Neurologická klinika: Spolupracujeme s IBM a s Neurona Lab při vývoji AI ve výzkumu (interpretace PET a MRI snímků).
Dr. Jan Stuchlý, vedoucí skupiny, Klinika dětské hematologie a onkologie: Používáme jak in-house modely, tak modely vytvořené jinými autory. Vesměs jde o neuronové sítě implementované v pytorch/tensorflow. Naším objektem zájmu jsou single-cell data (CITE-Seq, hmotnostní/průtoková cytometrie). Modely používáme pro anotaci buněk, dimensionální redukci a při odhalování dynamiky v datech (vývoj a aktivace buněk imunitního systému za fyziologických podmínek i patologické aberace těchto procesů).
Dr. Miroslav Koblížek, Ústav patologie a molekulární medicíny: Pro klinickou práci připravujeme zavedení pilotního testovacího provozu komerčních algoritmů pro automatické vyhodnocení procenta pozitivních buněk v markerech Ki-67, ER, PR a dalších. Pro výuku jsme využili drobnou konvoluční neurální síť vlastní výroby.
Prof. Jakub Otáhal, přednosta Ústavu patologické fyziologie: AI využíváme i rozvíjíme, například k automatické segmentaci lézí na MRI.
Doc. Martin Kynčl, Klinika zobrazovacích metod: Jedná se především o systém podpory lékaře v rámci radiodiagnostiky a epileptologie (projekty MELD, MAP18 pro detekci epileptogenních lézí v mozku), vývoj vlastních systémů detekce lézí na našem pracovišti.
Související
Doc. Martin Kynčl z Kliniky zobrazovacích metod 2. LF a FN Motol odpovídal v anketě serveru Živé.sk o umělé inteligenci (AI) v medicíně. Vztah mezi lékaři a AI v budoucnosti vnímá pozitivně.
Rozhovor s Kamilou Lepkovou, MSc., biomedicínskou inženýrkou, která bude jednou z hlavních přednášejících Vědecké konference.